El museo es la antigua casa donde vivió la familia Guevara durante la infancia de El Che. El lugar fue elegido debido a los problemas respiratorios que tenía en su niñez y, aunque en Alta Gracia las bondades climáticas mejoraron su asma, el problema lo acompañó toda su vida.
En la Casa Museo de Ernesto Che Guevara se exhiben testimonios, cartas, manuscritos y fotografías que permiten un recorrido por lo que fue la vida de la familia en esos años. También se pueden observar algunos muebles, homenajes, su famosa bicicleta a motor y una réplica idéntica de su moto.